Título: Identificação in-silico de potenciais biomarcadores em análise de metatranscriptômica do câncer gástrico na população paraense
Aluno: Daniel de Souza Avelar da Costa
Local: Videoconferência - Link
Data: 28/09/2021
Horário: 09h
Resumo:
A atuação do microbioma na progressão do Câncer Gástrico, na forma de Helicobacter pylori e o vírus Epstein-Barr é um fato extensivamente estudado na literatura devido sua capacidade de induzir a carcinogênese, bem como demandar tratamentos específicos, respectivamente. Sendo assim, a caracterização do microbioma bacteriano e viral e o estudo das associações do microorganismos ali presentes figuram-se como uma ferramentas valiosas para melhor compreensão da contribuição desse fator na equação cujo produto final é o Câncer Gástrico. Portanto, o presente estudo visa propor uma metodologia para a caracterização taxonômica dos microorganismos presentes no microbioma associado ao Câncer Gástrico de pacientes paraenses do Hospital Universitário João de Barros Barreto. Este método, que utiliza as ferramentas Trimmomatic, Centrifuge e Recentrifuge, tem como finalidade descrever o microbioma bacteriano e viral de amostras de metatranscriptoma, garantir a confiabilidade destes resultados e compará-los tanto coma literatura, quanto com os resultados do programa SRNAnalyzer. Ao comparar os 40 microorganismos mais encontrados neste trabalho com de outros artigos, ao menos 4 bactérias comuns a todos foram encontradas, demonstrando a viabilidade do método.
Banca Examinadora:
- Dr. Fabiano Cordeiro Moreira (Orientador - UFPA)
- Dr. Paulo Pimentel de Assumpção (UFPA)
- Dr. Rommel Thiago Jucá Ramos (UFPA)