Vigilância genômica e análise da dispersão do SARS-CoV-2 na Amazônia brasileira

Título: Vigilância genômica e análise da dispersão do SARS-CoV-2 na Amazônia brasileira

Aluno: Catarina Torres Pinho

Local: Auditório do LGHM | Link para assistir por videoconferência

Data: 30/06/2023

Horário: 15h

Resumo:

A pandemia causada pelo novo coronavírus (SARS-CoV-2) provocou inúmeras modificações na sociedade geral e na comunidade científica. Desde 2020, inúmeras pesquisas foram realizadas com o intuito de auxiliar a elucidar os mecanismos de interações do vírus com o hospedeiro, assim como de sanar as consequências do surgimento de diferentes variantes ao redor do globo, em um curto período. Neste contexto, foi sequenciado o genoma do SARS-CoV-2 e esclarecido as bases moleculares que auxiliariam as melhores formas de enfrentar o vírus e suas crescentes variantes. Portanto, tornou-se essencial analisar este cenário no estado do Pará, que foi um dos estados da região Norte mais atingido e impactado pela pandemia. Dessa forma, o objetivo principal deste estudo foi investigar e caracterizar as sequências genômicas do SARS-CoV-2, a fim de identificar variantes e linhagens do vírus que estejam associadas aos riscos de agravamento da COVID-19, além de analisar a filodispersão das variantes em municípios paraenses. O presente estudo conta com 1003 amostras de pacientes do estado do Pará, coletadas de 2020 até 2022, tanto de saliva quanto de swab. O RNA viral foi extraído a partir dessas amostras, e foram realizados as análises moleculares da RT-qPCR e o sequenciamento, para identificação das linhagens e variantes presentes nas amostras, seguido das análises estatísticas e bioinformáticas. Em relação às amostras, foram identificados 496 (49,45%) participantes eram do sexo feminino e 507 (50,55%) eram do sexo masculino, com uma idade média de 43 anos. A variante Gama foi responsável pelo maior número de casos, com 290 (28,91%) registros, seguida pela variante Delta com 53 (5,28%) casos. Além disso, foram encontrados sete (0,69%) casos da variante Ômicron e 651 (64,9%) casos não relacionados a VOCs. Foi observada uma associação significativa entre o sexo dos participantes e o quadro clínico (p = 8,65e-08 para o sexo feminino; p = 0,008961 para o sexo masculino), assim como com a idade (p = 3,6e-10). Ademais, foram realizadas análises de filodispersão e filogeografia, que indicaram correlações entre as variantes circulantes no estado do Pará, até a última data de coleta.

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