Caracterização do perfil molecular de genes de replicação e reparo em populações ameríndias da Amazônia

Título: Caracterização do perfil molecular de genes de replicação e reparo em populações ameríndias da Amazônia

Aluno: Amanda de Nazaré Cohen Paes

Local: Auditório do NPO

Data: 20/12/2022

Horário: 10h

Resumo:

A “era das ômicas” tem chamado atenção pela grande quantidade de dados disponíveis para investigações extensivas dentro das populações e entre as populações. Técnicas de sequenciamento em larga escala permitem a identificação de marcadores moleculares associados à predisposição, diagnóstico e sucesso terapêutico de diversas patologias. Grande parte dos estudos realizados até o presente, entretanto, são realizados em populações caucasianas, e raros estudos foram realizados em populações miscigenadas e ameríndias. Os grupos Nativo Americanos do Brasil possuem um perfil genético único, devido a um longo processo de isolamento geográfico, cruzamentos endogâmicos e deriva genética. Essas populações apresentam uma baixa variabilidade genética quando comparada às outras populações continentais, de modo que dados gerados para outras populações mundiais podem não ser extrapolados ou aplicáveis ás populações ameríndias. Pouco se tem conhecimento a respeito do perfil molecular dos ameríndios do Brasil, além das possíveis implicações de variantes genéticas presentes nessas populações, que possam causar impacto clínico na saúde desses povos e de populações com elevado grau de ancestralidade genômica ameríndia, como a brasileira. Adicionalmente, a epidemiologia molecular também pode permitir a descoberta e caracterização de novos marcadores moleculares nesta população, ou auxiliar na validação do conhecimento de estudos anteriores em outras populações. Dessa forma, o objetivo deste trabalho é caracterizar o perfil molecular de 18 genes de replicação e reparo do DNA em populações ameríndias, e comparar os achados com dados da população brasileira descrita no Arquivo Brasileiro Online de Mutações (ABraOM), bem como com dados de cinco populações continentais disponíveis no Banco de Dados de Agregação de Genoma (gnomAD). Para isso, utilizamos os dados obtidos através do sequenciamento completo do Exoma de 64 indivíduos ameríndios. As bibliotecas foram preparadas usando os kits Nextera Rapid Capture Exome (Illumina) e SureSelect Human All Exon V6 (Agilent). A análise de bioinformática foi realizada pelo software ViVa®. Encontramos em nossa análise mais de 432 variantes. Após a aplicação de nossos critérios de seleção, descrevemos a frequência alélica de 55 variantes em genes de reparo, das quais 7 não somente foram diferencialmente distribuídas nas populações Nativo Americanas, mas apresentam impacto clínico signficativo. Adicionalmente, descrevemos 9 variantes nunca antes descritas em outras populações. Quanto aos os genes de replicação, descrevemos a frequência alélica de 45 variantes, todas com impacto clínico relevante. Destas, 16 variantes foram diferencialmente distribuídas nas populações ameríndias investigadas quando comparadas às populações continentais e à população brasileira. Descrevemos ainda 8 SNVs exclusivos da população Nativo Americana da Amazônia barasieira. Nosso estudo reforça o entendimento de que a população ameríndia amazônica apresenta um perfil genético único, e nossos achados podem colaborar com a criação de políticas públicas que otimizem a qualidade de vida desses grupos, bem como da população brasileira, que apresenta alto grau de mistura interétnica com grupos essa população.

Banca Examinadora: