Susceptibilidade genética em pacientes com tuberculose em uma população da Região Amazônica brasileira

Título: Susceptibilidade genética em pacientes com tuberculose em uma população da Região Amazônica brasileira

Aluno: Diana Feio da Veiga Borges Leal

Local: Auditório do NPO

Data: 29/03/2022

Horário: 09h

Resumo:

A tuberculose (TB) é uma infecção causada pelo Mycobacterium tuberculosis com alta incidência e mortalidade. Polimorfismos de base única (SNPs) e ancestralidade Ameríndia podem estar envolvidos na susceptibilidade à tuberculose. O primeiro estudo investigou o potencial papel da ancestralidade genética ameríndia na suscetibilidade à infecção por tuberculose em uma população da região amazônica altamente miscigenada. Este estudo caso-controle incluiu 280 indivíduos diagnosticados com tuberculose e 138 indivíduos, trabalhadores de saúde, saudáveis, sem histórico de TB, e em contato com pacientes com a tuberculose ativa. Para determinar a ancestralidade europeia, africana e ameríndia, 61 Marcadores Informativos de Ancestralidade foram genotipadas por PCR multiplex. As amplificações foram realizadas utilizando o QIAGEN Multiplex PCR Kit. A visualização da amplificação foi feita em gel de agarose e a separação dos fragmentos por eletroforese capilar. A análise dos resultados foi efetuada com o software GeneMarker e o software STRUCTURE v2.3.4 foi utilizado para estimar as proporções de mistura africana, europeia e ameríndia nas amostras estudadas. Os resultados mostram que a composição étnica do grupo caso foi de 25,4% para Africanos, 40,9% Europeus e 33,7% Ameríndios, enquanto na composição do grupo controle foi 21,6% para Africano, 49,9% Europeu, 28,5% Ameríndios. Esses resultados sugeriram um aumento da contribuição da ancestralidade Ameríndia e perda de contribuição de ascendência europeia no grupo de casos em comparação com o grupo de controle. A influência da faixa de ancestralidade Ameríndia na suscetibilidade dos indivíduos à TB foi avaliada usando modelo logístico de regressão multivariada com sexo como covariável. Esta análise indicou que a ancestralidade da Ameríndia na faixa de 20% a 60% era um fator de risco para suscetibilidade a TB, com pico de risco na porção superior desta faixa (40-50%). Neste trabalho, conclui-se que a ancestralidade Ameríndia é um importante fator de risco para suscetibilidade à tuberculose em população da região amazônica. O segundo estudo teve como objetivo realizar um estudo de associação entre 26 SNPs e tuberculose e avaliar se essas variantes genéticas podem conferir fatores de risco para tuberculose na população Amazônica. Este estudo caso-controle foi realizado em 190 indivíduos com TB ativa e 178 controles saudáveis. Vinte e seis polimorfismos de nucleotídeo único foram selecionados por estarem relacionados a processos biológicos, respostas imunes, tuberculose ou doenças infecciosas. Amostras de DNA foram extraídas usando Mini Spin Plus Extraction e quantificadas por espectrofotometria. As amplificações e genotipagens das amostras para os polimorfismos foram realizadas através da reação em cadeia da polimerase em tempo real (RT-PCR), com a tecnologia de discriminação alélica TaqMan OpenArray, em um aparelho QuantStudio™12K Flex. A análise dos dados foi realizada usando o software TaqMan® Genotyper. O controle do efeito da miscigenação da população foi realizado através de Marcadores Informativos de Ancestralidade para evitar as associações espúrias. Neste estudo foram encontradas sete variantes genéticas significativamente associadas a indivíduos com tuberculose em indivíduos da região Amazônica. A investigação revelou que os SNPs rs10035440 (DROSHA), rs7372209 (miR26-a1), rs1834306 (miR100), rs4919510 (miR608), rs10739971 (pri-let-7a-1) foram significativamente associados com alto risco de tuberculose. Além disso, os SNPs rs3746444 (miR499) e rs6505162 (miR423) foram significativamente associados a um baixo risco de desenvolver a doença. Nosso estudo contribuiu para uma melhor compreensão da patogênese da TB e pode promover o desenvolvimento de novas ferramentas de diagnóstico contra a infecção por M. tuberculosis.

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