Perfil taxonômico e funcional do microbioma do câncer gástrico

Título: Perfil taxonômico e funcional do microbioma do câncer gástrico

Aluno: Mayara Quaresma Nascimento

Local: Auditório do NPO

Data: 27/12/2018

Horário: 09h

Resumo:

O câncer gástrico é a quarta causa mais frequente de câncer no mundo. A maior parte encontra-se em países em desenvolvimento, como o Brasil. Entre os principais carcinógenos conhecidos destaca-se a bactéria Helicobacter pylori. Além desta bactéria, outros microrganismos podem estar relacionados com o desenvolvimento da neoplasia. Sendo assim, pesquisas envolvendo a microbiota do câncer gástrico, bem como a expressão gênica destes microrganismos em câncer gástrico fazem-se necessários. O objetivo do presente estudo foi descrever o perfil taxonômico e funcional do microbioma do câncer gástrico. Foram coletadas amostras de biopsia de 8 pacientes com câncer gástrico do Hospital Universitário João de Barros Barreto (HUJBB), sendo sequenciadas pelo método de Sequenciamento de Nova Geração (WMS), com o auxílio de plataformas em bioinformática. Foi realizada análise em transcriptoma para conhecimento da taxonomia e metatranscriptômica para perfil de expressão gênica bacteriana, através de alinhamento com o genoma humano e alinhamento das leituras de microrganismos. Foram obtidos 20 taxons mais presentes, sendo os principais Acinetobacter baumanii, Pseudomonas syringae, Herbaspirillum rubrisubalbicans, Pseudomonas aeruginosa e Salmonella enterica. Também foram obtidas os 20 principais expressões proteicas bacterianas, algumas delas: chaperonas HtpG e Dnak, actina, ubiquitina, GADPH. Considerando os resultados do presente estudo sugere-se que Helicobacter pylori não é o principal patógeno presente em pacientes com câncer gástrico, porém uma diversificada microbiota compõe este microambiente tumoral, bem como a expressão proteica bacteriana, podendo ainda caracterizar maior virulência ao patógeno.

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